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科學(xué)家重建30億年前基因組化石

    據(jù)美國(guó)物理學(xué)家組織網(wǎng)12月20日(北京時(shí)間)報(bào)道,化石有助于古生物學(xué)家編寫自那時(shí)起的生命進(jìn)化史,但要繪制出早于寒武紀(jì)的30億年前的生命圖景,還非常困難。因?yàn)楹浼o(jì)前的軟體動(dòng)物細(xì)胞很少留下化石印記,但這些早期的生命卻留下了一些微小的化石:DNA。麻省理工學(xué)院的生物學(xué)家利用現(xiàn)代基因組,在一系列基因進(jìn)化規(guī)則之下重新構(gòu)造了古老的微生物,并鑒別出了許多跟氧氣有關(guān)的新基因,首次提出可能是氧氣的出現(xiàn)導(dǎo)致了“太古代大爆發(fā)”(Archean Expansion)。
 
  研究人員埃里克·阿爾姆和博士生勞倫斯·戴維從100個(gè)現(xiàn)代基因組中找到了曾首次在地球上出現(xiàn)的數(shù)千個(gè)基因,并用這些基因生成了基因組化石,通過(guò)對(duì)基因組化石的研究,可以發(fā)現(xiàn)這些基因的出現(xiàn)時(shí)間和哪些微生物擁有這些基因。研究顯示,該基因組化石為33億—28億年前這段時(shí)間所有生命的共同基因組,而在此期間,地球現(xiàn)存基因族系中的27%已經(jīng)出現(xiàn)。他們將這一時(shí)期命名為“太古代大爆發(fā)”。

  研究發(fā)現(xiàn),直到25億年前,地球大氣中才出現(xiàn)了氧氣并逐漸積累,由此在“大氧化事件”中殺死了大量的厭氧生物!按笱趸录笨赡苁羌(xì)胞生命史中最大的悲劇事件,我們卻沒有它的任何生物記錄。

  經(jīng)過(guò)進(jìn)一步分析顯示,利用氧氣的基因直到28億年前“太古代大爆發(fā)”末期才出現(xiàn),這更為基因化學(xué)家所設(shè)想的“大氧化事件”增加了證據(jù)。

  研究人員認(rèn)為,正是一種有氧光合作用,形成了“大氧化事件”中的氧氣,也形成了我們今天所呼吸的氧氣。太古代時(shí)期電子轉(zhuǎn)移(指細(xì)胞膜內(nèi)部的生物化學(xué)過(guò)程,伴隨著植物或微生物呼吸氧氣的光合作用而發(fā)生,由此直接固定來(lái)自于陽(yáng)光的能量。)逐漸進(jìn)化,經(jīng)過(guò)生命歷史的幾個(gè)關(guān)鍵階段,包括光合作用和呼吸,最終使大量的能量被固定下來(lái),存儲(chǔ)在生物圈中。

  “據(jù)我們的研究結(jié)果,尚不能判斷是否電子轉(zhuǎn)移的進(jìn)化直接造成了‘太古代大爆發(fā)’。”戴維說(shuō),“但我們推測(cè)是出現(xiàn)了一種讓生物圈獲得大量的能量的方法,從而產(chǎn)生了更復(fù)雜的微生物系統(tǒng)。”

  通過(guò)分析與基因有關(guān)的金屬和分子,以及它們?cè)陂L(zhǎng)期內(nèi)的演變,戴維和阿爾姆也研究了“太古代大爆發(fā)”之后微生物基因組的進(jìn)化。他們發(fā)現(xiàn)利用氧氣的基因比例越來(lái)越大,與銅和鉬相關(guān)的酶也是如此,這與地質(zhì)學(xué)的進(jìn)化記錄相一致。

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